Class 1 integrons in clinical and swine industry isolates of Salmonella Typhimurium from Colombia, dating 1997 to 2017.

Background. Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) has been linked to outbreaks of foodborne gastroenteritis disease, and the emergence of antimicrobial-resistant clones. In Colombia, laboratory surveillance of Salmonella spp. between 1997-2018 revealed that S. Typhimurium was the most ubiquitous serovar (27.6 % of all Salmonella isolates), with increasing levels of resistance to several families of antibiotics.Hypothesis. Resistant isolates of S. Typhimurium recovered from human clinical, food and swine samples carry class 1 integrons that are linked to antimicrobial resistance genes.Aim. Identify class 1 integrons, and investigate their association with other mobile genetic elements, and their relationship to the antimicrobial resistance of Colombian S. Typhimurium isolates.Methods. In this study, 442 isolates of S. Typhimurium were analysed, of which 237 were obtained from blood culture, 151 from other clinical sources, 4 from non-clinical sources and 50 from swine samples. Class 1 integrons and plasmid incompatibility groups were analysed by PCR and whole-genome sequencing (WGS), and regions flanking integrons were identified by WGS. The phylogenetic relationship was established by multilocus sequence typing (MLST) and single-nucleotide polymorphism (SNP) distances for 30 clinical isolates.Results . Overall, 39 % (153/392) of the human clinical isolates and 22 % (11/50) of the swine S. Typhimurium isolates carried complete class 1 integrons. Twelve types of gene cassette arrays were identified, including dfr7-aac-bla OXA-2 (Int1-Col1), which was the most common one in human clinical isolates (75.2 %, 115/153). Human clinical and swine isolates that carried class 1 integrons were resistant to up to five and up to three antimicrobial families, respectively. The Int1-Col1 integron was most prevalent in stool isolates and was associated with Tn21. The most common plasmid incompatibility group was IncA/C.Conclusions. The widespread presence of the IntI1-Col1 integron in Colombia since 1997 was striking. A possible relationship between integrons, source and mobile elements that favour the spread of antimicrobial resistance determinants in Colombian S. Typhimurium was identified.

Detección e identificación de Salmonella spp. en huevos para consumo humano, provenientes de diferentes localidades de Bogotá, Colombia, 2015 / Salmonella spp. isolation and identification in eggs for human consumption from different urban areas in Bogotá, Colombia, 2015

Objetivo: Determinar la prevalencia de Salmonella spp. en muestras de huevos para consumo humano en localidades de Bogotá. Materiales y métodos: Se obtuvieron 96 muestras en tiendas y plazas de mercado de 4 localidades de la ciudad. Se procesó de forma separada la cáscara y el contenido interno mediante métodos microbiológicos y moleculares para aislamiento e identificación Salmonella spp. Resultados: Se determinó una prevalencia total de Salmonella spp. de 9,4% (n=9), de ésta el 55% (n = 5) provenían del contenido interno y 44% (n = 4) de cáscara, sin embargo no se logró tipificar el serovar de Salmonella enterica presente. Las localidades con mayor presencia del patógeno fueron Usaquén y Fontibón. Discusión: Estudios realizados en Colombia evidencian bajas prevalencias de Salmonella spp. (0 -1,74%) en muestras de huevos, sin embargo los hallazgos de este estudio evidencian una mayor recuperación, lo que podría asociarse con inadecuadas condiciones de manejo y/o almacenamiento del producto. Conclusión: Se estableció la presencia de Salmonella spp. en las muestras de huevo evaluadas, lo que implica un riesgo potencial para la salud pública, por lo que es necesario ampliar este tipo de estudios para conocer la situación real a nivel nacional frente a este patógeno.

Objective: To determine the prevalence of Salmonella spp presence in eggs for human consumption in urban areas in Bogota. Materials and methods: 96 samples were collected from convenience stores and markets in 4 urban areas in the city. The eggshells were separated from the egg's internal content and both were processed separately using microbiological and molecular techniques to isolate and identify Salmonella spp. strains. Results: A Salmonella spp. prevalence of 9.4% (n=9) was found. Salmonella spp was isolated from the egg's internal content in 55% (n=5) of samples and 44% (n=4) from the eggshells. The Salmonella enterica serovar could not be identified. The pathogen was more frequently isolate in samples from Usaquén and Fontibón urban areas. Discussion: Studies of Salmonella spp. prevalence in eggs done in Colombia have shown it to be low (0-1.74%); However, this study determined a higher prevalence. These results suggest that inadequate handling/storage conditions could have been associated with them. Conclusion: Salmonella spp. was isolated from the egg samples from 4 different urban areas in Bogotá. These findings suggest the existence of a public health risk; therefore, there is a need to perform wider and more complete studies to determine the actual situation of Salmonella ssp. egg contamination in the country.

Evaluación de tres métodos para la inactivación de coliformes y Escherichia coli presentes en agua residual doméstica, empleada para riego / Evaluation of three methods for the inactivation of coliforms and Escherichia coli present in domestic wastewaters used in irrigation / Avaliação de três métodos para a inativação de coliformes totais e Escherichia coli presentes em águas residuais domésticas utilizadas para a irrigação

Objetivo. Evaluar tres tratamientos (lagunaje, fotocatálisis con TiO2 y desinfección química) para la inactivación de coliformes totales y Escherichia coli presentes en agua residual doméstica empleada para riego agrícola. Materiales y métodos. El agua residual fue caracterizada por medio de análisis físicos, químicos y microbiológicos. Posteriormente fue sometida a un tratamiento de lagunaje facultativo (TLF), pos tratamiento fotocatalítico (PTFTiO2/UV) y pos tratamiento químico (PTQ NaClO). Valorando la capacidad desinfectante de cada uno de ellos para inactivar coliformes totales y E. coli. A continuación se procesaron tres nuevos lotes de agua residual y se utilizaron para realizar pruebas de riego a escala de laboratorio por 30 días, empleando como modelo plantas de Lactuca sativa variedad Batavia y evaluando la concentración inicial y final de los dos grupos. Resultados. El PTFTiO2/UV fue significativamente superior que TLFLF y el PTQ NaClO (p<0,0001) obteniendo 100% de inactivación para coliformes y E. coli a los 30 minutos de irradiación a escala de reactor. Respecto a las pruebas de riego de L. sativa se demostró que al utilizar el agua tratada por PTFTiO2/UV no se presentó contaminación con E. coli y coliformes a los 30 días de proceso. Por el contrario en las plantas regadas con agua tratada por TLF y PTQ NaClO se observó un incremento en las dos poblaciones generando un problema de contaminación de las hortalizas al finalizar la prueba de laboratorio. Conclusión. La fotocatálisis heterogénea TiO2 fue un método eficaz para la reducción de coliformes y E.coli en aguas residuales domésticas.

Objective. To evaluate three treatments (facultative stabilization ponds, heterogeneous photocatalysis with TiO2 and chemical disinfection with sodium hypochlorite) for the inactivation of coliforms and Escherichia coli presen in domestic wastewaters used in agricultural irrigation. Materials and methods. Wastewater was characterized by physical, chemical and microbiological analyses and was then exposed to a facultative pond treatment (FPT), post-photocatalytic treatment (PTFTiO2/UV) and post-chemical treatment (PTQNaClO) to assess the disinfecting capacity of each method in the inactivation of total coliforms and E. coli. Three new samples of wastewater were processed and used in irrigation tests on a laboratory-scale basis for 30 days, using Lactuca sativa cultivar. Batavia as a model plant and evaluating the initial and final concentrations of the two groups. Results. PTFTiO2/UV was significantly higher than FPT and PTQNaClO (p<0.0001), obtaining 100% of inactivation of coliforms and E. coli after 30 minutes of irradiation at a reactor scale. Regarding the irrigation tests with L. sativa, we showed that using water treated by PTFTiO2/UV there is no contamination with E. coli and coliforms after 30 days. On the contrary, plants irrigated with water treated by FPT and PTQNaClO showed an increase in the two populations originating a contamination problem in the vegetable by the end of the laboratory experiments. Conclusion. The heterogeneous photocatalysis with TiO2 was an effective method in the reduction of coliforms and E. coli present in domestic wastewater.

Objetivo. Avaliar três tratamentos (lagoas, fotocatálise com TiO2 e desinfecção química) para inativação de coliformes totais e Escherichia coli presentes em águas residuais domésticas utilizadas na irrigação dos cultivos. Materiais e métodos. O efluente foi caracterizado por analises físicos, químicos e microbiológicos. Posteriormente foi submetido a tratamento de lagoas facultativas (TLF), pós-tratamento fotocatalítico (PTF TiO2/UV) e pós-tratamento químico (PTQ NaClO). Avaliando a capacidade desinfetante de cada um para inativar coliformes totais e E. coli. Posteriormente, foram processados três novos lotes de águas residuais para testar a irrigação em escala de laboratório por 30 dias, utilizando-se como modelo plantas de Lactuca sativa variedade Batavia e avaliando a concentração inicial e final dos dois grupos. Resultados. O PTFTiO2/UV foi significativamente maior a TLFLF e PTQ NaClO (p<0,0001) apresentando 100% de inativação para coliformes e E. coli em 30 minutos de irradiação a escala do reator. Quanto aos testes de irrigação de L. sativa foi demonstrado que, ao utilizar a água tratada com PTFTiO2/UV não se apresentou contaminação com E. coli e coliformes a 30 dias do tratamento. Em contrapartida, em plantas irrigadas com água tratada por TLF e PTQ NaClO observou-se um aumento nas duas populações gerando um problema de contaminação de hortaliças no final do teste de laboratório. Conclusão. A fotocatálise heterogênea TiO2 foi um método eficaz para reduzirem coliformes e E. coli em águas residuais domésticas.

Incidencia de Listeria spp. en carcasas de pollo congelado en un supermercado del nororiente de Bogotá / Incidence of Listeria spp., in frozen poultry carcasses at supermarket in northwest Bogotá

Listeria spp. es un género bacteriano que contamina alimentos de origen animal, incluido el pollo, yl puede permanecer viable durante las cadenas de producción y distribución. En el presente trabajo se analizaron 91 muestras de carcasas de pollo, obtenidas en una distribuidora en el nororiente de Bogotá; las muestras se tomaron en un período de 9 semanas y luego fueron procesadas. De las 91 carcasas, 40 (43.95%) resultaron positivas para Listeria spp. La presencia de este microorganismo puede estar asociada a deficiencias en los sistemas de tecnología de limpieza en las plantas de beneficio y/o contaminación con utensilios durante el desprese.

Resistencia antimicrobiana y a desinfectantes de Listeria spp: [revisión] / Antimicrobial and disinfectants resistance of Listeria spp: [review]

Listeria spp. es un género bacteriano que se adapta fácilmente a cambios ambientales y a condiciones químicas y físicas, por eso no es sorprendente la aparición de resistencia a desinfectantes de uso frecuente en las industrias de alimentos. La capacidad para adquirir genes de resistencia antimicrobiana a partir de otras especies bacterianas, hace que este género deba ser observado cuidadosamente desde el punto de vista epidemiológico. Aunque aún no se ha demostrado que el abuso de antimicrobianos como promotores de crecimiento en la producción de animales (vacas, cerdos y aves, entre otros), esté relacionado directamente con el aumento de la resistencia antimicrobiana, es inevitable llamar la atención sobre esta práctica. En este artículo se hace una revisión sobre la taxonomía, el serotipo, factores de virulencia, el uso de antibióticos en la industria y la resistencia antimicrobiana de Listeria spp.